{"id":176,"date":"2021-07-02T19:30:30","date_gmt":"2021-07-02T17:30:30","guid":{"rendered":"http:\/\/ntsafack.com\/?page_id=176"},"modified":"2021-07-03T09:54:21","modified_gmt":"2021-07-03T07:54:21","slug":"ecologie-et-ecotoxicologie-de-orius-sp-mcf-avignon","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/ecologie-et-ecotoxicologie-de-orius-sp-mcf-avignon\/","title":{"rendered":"\u00c9cologie et \u00e9cotoxicologie de Orius sp. (MCF Avignon)"},"content":{"rendered":"\n<p>Projet propos\u00e9 dans le cadre d&#8217;une candidature \u00e0 Avignon dans l&#8217;UMR IMBE \u00e9quipe BES. <\/p>\n\n\n\n<h3><strong>\u00c9cologie et \u00e9cotoxicologie d\u2019un pr\u00e9dateur g\u00e9n\u00e9raliste : La punaise anthocorid\u00e9 <em>Orius sp<\/em><\/strong>.<\/h3>\n\n\n\n<p><em><strong>IV.2.1. Contexte<\/strong><\/em><\/p>\n\n\n\n<p>La production de pommes constitue une culture importante \u00e9conomiquement en particulier dans la r\u00e9gion Sud-Est. En effet, la r\u00e9gion produit les 25% de pommes r\u00e9colt\u00e9es en France (1,67 million de tonnes)<a href=\"#sdfootnote1sym\"><sup>1<\/sup><\/a>. L\u2019\u00e9tude de l\u2019entomofaune (ravageurs et auxiliaires) des vergers permet d\u2019optimiser la production tout en mod\u00e9rant l\u2019apport d\u2019intrants chimiques. Dans un contexte de changement climatique o\u00f9 l\u2019\u00e9quilibre des processus \u00e9cologiques comme les services \u00e9cosyst\u00e9miques est menac\u00e9, <strong>la dynamique des communaut\u00e9s des auxiliaires de culture ressort comme un sujet de recherche<\/strong> <strong>primordial<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n<p>Ce projet s\u2019int\u00e9resse \u00e0 l\u2019\u00e9cologie et \u00e0 l\u2019\u00e9cotoxicologie d\u2019un groupe d\u2019auxiliaires du verger : les punaises anthocorid\u00e9s <em>Orius sp<\/em>. Les punaises anthocorid\u00e9s sont des pr\u00e9dateurs g\u00e9n\u00e9ralistes, pr\u00e9sentes dans plusieurs syst\u00e8mes de culture dont les vergers. Dans les vergers, les punaises anthocorid\u00e9s (larves et adultes) sont pr\u00e9datrices de pucerons et d\u2019autres ravageurs. Le potentiel de pr\u00e9dation de ces g\u00e9n\u00e9ralistes est encore peu \u00e9tudi\u00e9. De plus, les effets des pesticides sur ces auxiliaires ne sont pas connus.<\/p>\n\n\n\n<p>L\u2019\u00e9quipe BES a d\u00e9j\u00e0 r\u00e9alis\u00e9 des \u00e9tudes similaires sur d\u2019autres auxiliaires de culture notamment sur les forficules, mon projet les continuera et les compl\u00e9tera. J\u2019ai toutes les comp\u00e9tences n\u00e9cessaires pour mener \u00e0 bien ce projet et pourrait \u00e9galement m\u2019appuyer sur les comp\u00e9tences de l\u2019\u00e9quipe en support.<\/p>\n\n\n\n<p><em><strong>IV.2.2. Objectifs scientifiques<\/strong><\/em><\/p>\n\n\n\n<p>Ce projet s\u2019int\u00e9resse \u00e0 l\u2019\u00e9cologie et \u00e0 l\u2019\u00e9cotoxicologie d\u2019un groupe d\u2019auxiliaires du verger : les punaises anthocorid\u00e9s <em>Orius sp<\/em>. Il s\u2019agit d\u2019une part de d\u00e9velopper des connaissances autour des m\u00e9canismes (pratiques agricoles, changement globaux) qui expliquent la distribution et l\u2019abondance des communaut\u00e9s d\u2019anthocorid\u00e9s et parall\u00e8lement mener des exp\u00e9rimentations au laboratoire sur les effets des produits phytosanitaires.<\/p>\n\n\n\n<p>Il s\u2019agira notamment de d\u00e9velopper les points suivants :<\/p>\n\n\n\n<ul><li><strong><em>Au laboratoire <\/em><\/strong>: Nous \u00e9tudierons les <strong>effets des pesticides<\/strong> les plus courants sur les anthocorid\u00e9s par des mesures associ\u00e9es aux <strong>traits biologiques<\/strong> (production d\u2019\u0153ufs, succ\u00e8s de l\u2019\u00e9closion, potentiel de pr\u00e9dation\u2026).<\/li><li><strong><em>Sur le terrain<\/em><\/strong> : Nous \u00e9tudierons comment diff\u00e9rents facteurs influencent les communaut\u00e9s des anthocorid\u00e9s.<ul><li><strong>Facteurs locaux<\/strong> (microclimat, sol, pratiques agricoles)<\/li><li><strong>Facteurs globaux<\/strong> (gradient de temp\u00e9rature, humidit\u00e9)<\/li><li><strong>Facteurs paysagers<\/strong> (composition, cultures attenantes, fragmentation, habitats potentiels)<\/li><\/ul><\/li><\/ul>\n\n\n\n<ul><li><strong><em>Mod\u00e9lisation 1<\/em><\/strong>&nbsp;: Nous mod\u00e9liserons les effets propres et conjugu\u00e9s des facteurs locaux (comme les pratiques agricoles) et des facteurs paysagers en utilisant par exemple les mod\u00e8les <strong>SEM (Structural Equation Modeling)<\/strong>. Nous tenterons ainsi de comprendre les interactions entre les effets du paysage et les effets des pratiques agricoles.<\/li><li><strong><em>Mod\u00e9lisation 2<\/em><\/strong>&nbsp;: Nous mod\u00e9liserons de fa\u00e7on pouss\u00e9e les effets du changement climatique en utilisant l\u2019<strong>algorithme MaxEnt<\/strong>. Nous consid\u00e9rons d\u2019une part l\u2019enveloppe climatique de la proie (puceron), d\u2019autre part l\u2019enveloppe climatique de l\u2019esp\u00e8ce Anthocoridae dominante (pr\u00e9dateur). En recoupant les deux enveloppes, nous pourrons pr\u00e9dire avec plus de pr\u00e9cision la <strong>r\u00e9ponse du service de r\u00e9gulation face au changement climatique<\/strong>.<\/li><\/ul>\n\n\n\n<p><em><strong>IV.2.3. M\u00e9thodes<\/strong><\/em><\/p>\n\n\n\n<ul><li><strong>Sites d\u2019\u00e9tude<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Pour coordonner ce projet avec les activit\u00e9s de l\u2019\u00e9quipe les sites d\u2019\u00e9tudes seront s\u00e9lectionn\u00e9s sur les vergers de la r\u00e9gion d\u00e9j\u00e0 utilis\u00e9s par l\u2019\u00e9quipe.<\/p>\n\n\n\n<ul><li><strong>Echantillonnages<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Des enqu\u00eates seront r\u00e9alis\u00e9es aupr\u00e8s des exploitants pour collecter des donn\u00e9es sur les pratiques agricoles dont l\u2019IFT.<\/p>\n\n\n\n<p>Les donn\u00e9es sur les pucerons seront collect\u00e9es (comptage) et les pi\u00e8ges collants utilis\u00e9es pour collecter les anthocorid\u00e9s.<\/p>\n\n\n\n<ul><li><strong>Donn\u00e9es du paysage<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Les \u00e9l\u00e9ments du paysage seront relev\u00e9s. Il s\u2019agira notamment des diff\u00e9rents types d\u2019occupation du sol. Ces donn\u00e9es seront compl\u00e9t\u00e9es par les donn\u00e9es des images satellite. Ensuite, j\u2019utiliserai les outils d\u2019analyses spatiales QGIS (ou ArcGIS) pour caract\u00e9riser l\u2019organisation spatiale \u00e0 diff\u00e9rentes \u00e9chelles.<\/p>\n\n\n\n<ul><li><strong>Analyse au laboratoire<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>Au laboratoire, des \u00e9tudes seront r\u00e9alis\u00e9es pour l\u2019\u00e9levage de <em>Orius. Sp<\/em> (esp\u00e8ce \u00e0 d\u00e9terminer), les analyses biochimiques pour d\u00e9tecter et quantifier les polluants sur les insectes et sur la v\u00e9g\u00e9tation, et l\u2019identification des esp\u00e8ces pi\u00e9g\u00e9es.<\/p>\n\n\n\n<ul><li><strong>M\u00e9thodes statistiques<\/strong><\/li><\/ul>\n\n\n\n<p>En plus de SEM et MaxEnt pr\u00e9sent\u00e9s plus haut, j\u2019utiliserai des outils statistiques que j\u2019ai d\u00e9j\u00e0 utilis\u00e9 avec succ\u00e8s dans mes projets pr\u00e9c\u00e9dents. Il s\u2019agira par exemple de techniques d\u2019analyses multivari\u00e9es comme l\u2019analyse canonique des correspondances (CCA), des mod\u00e8les lin\u00e9aires g\u00e9n\u00e9raux (GLM, GLMM), des mod\u00e8les des moindres carr\u00e9s partiels (PLS) dans les situations o\u00f9 nous aurons plus de pr\u00e9dicteurs que d\u2019observations, des mod\u00e8les de filtrage spatial des vecteurs propres (ESF) pour s\u2019affranchir des probl\u00e8mes d\u2019autocorr\u00e9lation spatiale pendant l\u2019analyse des effets des facteurs paysagers si jamais pour des questions de logistique les sites d\u2019\u00e9chantillonnages \u00e9taient spatialement d\u00e9pendants.<\/p>\n\n\n\n<p>Par ailleurs j\u2019aimerai explorer des mod\u00e8les novateurs : Machines \u00e0 vecteur de support, arbres de d\u00e9cision, for\u00eats al\u00e9atoires<sup><a href=\"#sdfootnote2sym\"><sup>2<\/sup><\/a><\/sup>,<sup><a href=\"#sdfootnote3sym\"><sup>3<\/sup><\/a><\/sup>.<\/p>\n\n\n\n<p><em><strong>IV.2.4. Dimensionnement &#8211; faisabilit\u00e9<\/strong><\/em><\/p>\n\n\n\n<p>Au vu de mon exp\u00e9rience en protocole de terrain et en valorisation de donn\u00e9es, j\u2019estime que pour avoir des donn\u00e9es int\u00e9ressantes statistiquement (significatives) il faudra avoir une trentaine de points d\u2019\u00e9chantillonnages, avec des relev\u00e9s tous les mois du printemps au d\u00e9but de l\u2019automne. La prolongation du projet sur plusieurs ann\u00e9es permettrait d\u2019avoir des donn\u00e9es tr\u00e8s int\u00e9ressantes sur l\u2019\u00e9volution dans le temps des diff\u00e9rentes dynamiques pr\u00e9dateur\/proie. Le travail de terrain demandera l\u2019aide d\u2019au moins une personne (travail en bin\u00f4me). Les modalit\u00e9s de l\u2019\u00e9levage seront \u00e0 d\u00e9terminer.<\/p>\n\n\n\n<p>Au total, ce projet demandera peu de ressources pour de r\u00e9sultats scientifiques int\u00e9ressants et novateurs. Il n\u2019y a pas de difficult\u00e9s mat\u00e9rielles ou m\u00e9thodologiques majeures.<\/p>\n\n\n\n<p><em><strong>IV.2.5. Apports du projet<\/strong><\/em><\/p>\n\n\n\n<p>Ce projet compl\u00e9tera les r\u00e9sultats d\u00e9j\u00e0 obtenus par l\u2019\u00e9quipe et sera l\u2019un des premiers \u00e0 produire des r\u00e9sultats (articles dans des revues \u00e0 comit\u00e9 de lecture internationales) sur les facteurs influen\u00e7ant la dynamique et le potentiel de pr\u00e9dation des punaises dans les vergers. Ainsi, il permettra de formuler des recommandations plus pr\u00e9cises sur l\u2019utilisation de ces r\u00e9gulateurs biologiques et sur la modulation des pratiques agricoles suivant le paysage.<\/p>\n\n\n\n<p>Ce projet apportera \u00e9galement des r\u00e9sultats th\u00e9oriques de port\u00e9e plus g\u00e9n\u00e9rale d\u2019une part sur les r\u00e9ponses des syst\u00e8mes pr\u00e9dateur\/proie au changement climatique et d\u2019autre part sur la discrimination entre les effets du paysage et les effets des pratiques agricoles sur les communaut\u00e9s d\u2019auxiliaires.<\/p>\n\n\n\n<p>Le projet s\u2019inscrit donc tr\u00e8s bien dans les travaux de l\u2019\u00e9quipe BES, et apportera \u00e0 la fois des r\u00e9sultats scientifiques novateurs sur ces questions encore globalement peu \u00e9tudi\u00e9es, et des applications pratiques assez directes, ce qui sera d\u2019ailleurs un plus pour la recherche de financements.<\/p>\n\n\n\n<p><em><strong>IV.2.6. Int\u00e9gration au laboratoire<\/strong><\/em><\/p>\n\n\n\n<p>Les sites d\u2019\u00e9tude d\u00e9j\u00e0 utilis\u00e9s par l\u2019\u00e9quipe seront privil\u00e9gi\u00e9s. Je pourrai b\u00e9n\u00e9ficier des m\u00e9thodologies et des comp\u00e9tences de l\u2019\u00e9quipe, ainsi que du mat\u00e9riel de laboratoire existant.<\/p>\n\n\n\n<p>Au fil du projet, les comp\u00e9tences de l\u2019\u00e9quipe pourront m\u2019\u00eatre utiles en soutien.<\/p>\n\n\n\n<p><a href=\"#sdfootnote1anc\">1<\/a><sup> <\/sup>https:\/\/www.planetoscope.com\/fruits-legumes\/391-production-de-pommes-en-france.html<\/p>\n\n\n\n<p><a href=\"#sdfootnote2anc\">2<\/a>Fox et al, 2018. doi&nbsp;: 10.1007\/s10661-017-6025-0<\/p>\n\n\n\n<p><a href=\"#sdfootnote3anc\">3<\/a>Breiman 2001. doi: 10.1023\/A:1010933404324<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img loading=\"lazy\" width=\"942\" height=\"531\" src=\"http:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-179\" srcset=\"https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image.png 942w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-300x169.png 300w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-768x433.png 768w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-532x300.png 532w\" sizes=\"(max-width: 942px) 100vw, 942px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img loading=\"lazy\" width=\"942\" height=\"531\" src=\"http:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-1.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-180\" srcset=\"https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-1.png 942w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-1-300x169.png 300w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-1-768x433.png 768w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-1-532x300.png 532w\" sizes=\"(max-width: 942px) 100vw, 942px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img loading=\"lazy\" width=\"942\" height=\"531\" src=\"http:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-2.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-181\" srcset=\"https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-2.png 942w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-2-300x169.png 300w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-2-768x433.png 768w, https:\/\/ntsafack.com\/wp-content\/uploads\/2021\/07\/image-2-532x300.png 532w\" sizes=\"(max-width: 942px) 100vw, 942px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Projet propos\u00e9 dans le cadre d&#8217;une candidature \u00e0 Avignon dans l&#8217;UMR IMBE \u00e9quipe BES. \u00c9cologie et \u00e9cotoxicologie d\u2019un pr\u00e9dateur g\u00e9n\u00e9raliste : La punaise anthocorid\u00e9 Orius &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/176"}],"collection":[{"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=176"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/176\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":198,"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/176\/revisions\/198"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ntsafack.com\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=176"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}